概要
SeqStudioは、タンパク質の機能アノテーションを行うための生成型推論システムです。
配列相同性、構造類似性、ドメイン構造、膜トポロジーなど、多様なエビデンスをLLMフレームワーク内で統合し、BLASTやInterProScanなどの既存ツールからの出力を、構造化されたアノテーションと信頼度スコア付きの自然言語解説として生成します。
これにより、シーケンスや構造予測の急増によって生じる機能アノテーションのボトルネックを解消し、キュレーターのような詳細な記述を提供します。
CLIを通じてFASTA/PDBファイルやUniProt形式のJSON.gzデータを処理でき、研究者やバイオインフォマティクス担当者向けに、再現可能なアノテーション環境と統合的なキュレーション機能を提供します。
互換性・特徴
- LLM対応
- CLI
- Python
- データ出力: JSON
- GPU必須
基本情報
| ライセンス | MIT |
| Stars | 4 |
| カテゴリ | LLM |
| アクティビティ | low |