概要
DREID-Packは、DREIDING力場、Goldstein+Split DEE、tree-decomposition DPを駆使し、全原子レベルでのタンパク質側鎖パッキングのグローバル最小エネルギー構造を決定する高機能な純粋Rustライブラリです。
欠損原子の再構築、pHとpKaによるプロトン化状態割り当て、ヒスチジン互変異性体の詳細な処理、多様な分子（リガンド、核酸など）の自動パラメータ化を特徴とします。
特に物理的に正確な力場計算、詳細な化学的考慮、アルゴリズム最適化による高性能を求める生物物理学、構造生物学、薬剤設計分野の研究者を想定しています。
CLIおよびライブラリとして利用可能です。
互換性・特徴
- CLI
- Rust
- 高性能
- ライブラリ
- 生物物理学
- 構造生物学
基本情報
| ライセンス | MIT |
| Stars | 2 |
| カテゴリ | 3D / NeRF |
| アクティビティ | low |
最新リリース: v0.2.0 (2026-04-05)